İnsan patojenlerinin yaklaşık %60’ı zoonotik kökenli olduğundan, zoonotik hastalıklar küresel bir halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır. En önemli insan patojenlerinin çoğu ya zoonotiktir ya da insanlara adapte olmadan önce zoonotik hastalıklardan kaynaklanır. Sonuç olarak, insanlar sürekli olarak yeni hayvan patojenlerine maruz kalmaktadır. Son yıllarda Zika, Ebola, H1N1 influenza ve şiddetli akut solunum sendromu gibi zoonotik hastalıkların ortaya çıkması epidemiyolojik bütünlüğü tehdit etmektedir. Çeşitli risk değerlendirme çalışmaları, ortaya çıkan patojenlerin %75’inin zoonotik kökenli olduğunu tahmin etmektedir. Bu hastalıkların ortaya çıkışı, diğer şeylerin yanı sıra, nüfus artışı, şehirlerin büyümesi, doğal yaşam alanlarının tahrip edilmesi, tarımsal uygulamaların modernleşmesi ve iklim değişikliği ile ilgili olabilir.
Zoonoz hayvanlar ve insanlar arasında yayılabilen hastalıklardır. Mantarlar, parazitler, bakteriler ve virüsler gibi çeşitli zoonotik hastalıklara neden olan zoonozlar popülasyonda çok yaygın ve yüksek bir sıklığa sahiptir. Genellikle günlük aktiviteler sırasında hayvanlarla etkileşimlerden elde edilir. Taylor ve ekibi, insanları enfekte ettiği bilinen 1.415 patojenin %61’inin zoonotik veya zoonotik olduğunu bildirdi. Hayvanlar günlük yaşamda önemli varlıklardır. Bazıları evlerde evcil hayvan olarak yaşarken ve herkes hayvanat bahçesindeki hayvanlarla yakın temas halindeyken, hayvanlar dünya çapında çiftçilik uygulamalarının önemli bir parçasıdır.
Enfekte hayvanların tükürüğü, kanı, idrarı veya dışkısı zoonotik ajanları bulaştırır. Birkaç hayvan sadece çeşitli patojenleri insanlara taşır, ancak hastalanmaz. Bu hayvanlar taşıyıcı olarak tanımlanır. Muhtemelen en iyi bilinen vektör, sarı humma sivrisineği, sarı humma sivrisineğidir. Bu sivrisinek, Amerika, Afrika ve Asya’nın tropikal bölgelerinde önemli bir viral hastalık olan dang hummasının etken maddesidir. Zoonotik bir hastalığa yakalanmanın bir başka yolu da gıda tüketimidir. Pastörize edilmemiş süt, az pişmiş et veya balık ve enfekte hayvanların idrar ve dışkısıyla kontamine olmuş olabilecek yıkanmamış meyve ve sebzelerin tüketimi çok yaygındır. Zoonozlar ciddi olabilir ve zamanında teşhis ve tedavi edilmezse bazıları ölüme neden olabilir. Bu nedenle, hayvanlarla çalışırken, evcil hayvan beslerken, hayvan hobileri yaparken veya hayvanlardan gelen patojenlerle kontamine olmuş su veya yiyecekleri tüketirken zoonoz edinilebilir. Dünya Sağlık Örgütü, en yaygın zoonotik hastalıklardan biri olduğunu belirtmektedir. Bu zoonoz hastalıklar şu şekildedir:
• Her ikisi de kene ısırmasıyla bulaşan Lyme hastalığı ve Rocky Mountain benekli humması
• Sivrisineklerin ısırmasıyla bulaşan Batı Nil virüsü
• Enfekte sivrisinekler tarafından bulaşan dang humması, sıtma ve chikungunya
Civcivler, tavuklar, ördekler, kaplumbağalar veya yılanlar tarafından bulaşan Salmonella enfeksiyonu
• İnekler gibi enfekte hayvanlardan bulaşan Escherichia coli enfeksiyonu.
Bu nedenle zoonotik hastalıklar insan sağlığı için önemli bir risk oluşturmaktadır. Bu akılda tutularak, zoonotik ajanların epidemiyolojisini, dinamiklerini, dağılımını ve enfeksiyonunu anlamak veya incelemek için önemli araştırma projeleri geliştirilmektedir. Bununla birlikte, zoonotik ajanların teşhisi ve yeni zoonotik mikroorganizmaların ve virüslerin tanımlanması ve dağılımı, uluslararası bir halk sağlığı sorunu olmaya devam etmektedir. Bu nedenle, evcil hayvanların yanı sıra serbest yaşayan hayvanların mikrobiyotasının incelenmesi, yeni zoonotik hastalıkların tahmini ve tedavisi için yararlı bilgiler sağlar. Diğerlerinin yanı sıra moleküler biyoloji, immünoloji ve epidemiyoloji gibi çeşitli bilgi alanları bu amaç için dahil edilmiştir.
İçindekiler
konvansiyonel tanı
Zoonotik hastalıkların teşhisi için çeşitli metodolojiler geliştirilmiştir, örneğin mikroorganizmaların kültürlenmesi, çeşitli patojenlerin kolayca tanımlanmasına olanak tanır. Ancak bazıları bu yaklaşım kullanılarak kolayca tespit edilemez, bu durumda bu mikroorganizmalar hafife alınır veya genellikle yanlış teşhis edilir. Diğerleri baskındır, dolayısıyla bir ortamda yaygın ve önemli olabilirler. Kültür yöntemlerine paralel olarak dokulardan patojenlerin saptanmasına yönelik mikroskopi teknikleri zoonotik hastalıkların tanısında önemli destekler sağlamıştır. Bazı dokuların örneklenmesi genellikle çok invazivdir, bu da büyük bir dezavantajdır ve bu yöntemler tamamlayıcıdır.
Zoonotik hastalıkların teşhisinde zaman içinde önemli ilerlemeler kaydedilmiştir. Bu hastalıkları teşhis etmek için çeşitli antijen bazlı tahliller ve yöntemler kullanılmaktadır. Bu yöntemler arasında numunelerin işlenmesi, bütünlüklerinin iyileştirilmesi ve sonuçların raporlanması için gereken sürenin kısaltılması yer alır. İnsanlardan alınan serum örneklerinde antikorları tespit etmek için serolojik testler kullanılır ve aşağıdaki gibidir:
• Dolaylı flüoresan antikorlar
indirekt hemaglütinasyon testi,
eklentiyi kurun,
• Doğrudan istifleme testi
• Enzim bağlı immünosorbent deneyi
Bununla birlikte, farklı kalite ve hassasiyette bu tür bazı testler vardır, ancak günümüzde antikorların bulunabilirliği büyük bir sorundur. Farklı serotipleri ve diğer patojenik özellikleri hesaba katan patojen sınıflandırması, spesifik antikorların varlığı ile sınırlıdır. Genetik mühendisliği tarafından üretilen antijenlerin kullanıldığı Western blot ve immünokromatografi testleri gibi testler geliştirilmiştir. Bu testler, bir tür içindeki suşları ayırt etmek ve patojenik hastalık sürecinde yer alan spesifik virülans faktörlerini belirlemek için serolojik testlerin doğrulanmasına yol açtı. 1950’lerden beri, enfeksiyöz ajanların nükleik asitlerini manipüle etmek için polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), kısıtlama fragman uzunluğu polimorfizmi (RFLP) ve darbeli alan jel elektroforezi (PFGE) gibi çeşitli teknikler geliştirilmiştir.
Bu teknikler, hayvan patojenlerini teşhis etmek için başarıyla kullanılmıştır. Moleküler yöntemler yüksek özgüllük ve duyarlılık sunsa da, klinik tanıdan çok araştırma çalışmalarında kullanılmaktadır. Bu testlerin yüksek maliyeti yukarıdakileri açıklayabilir. Moleküler teşhis, tek bir patojeni veya karışımlarını tanımlamak için tasarlanmıştır, ancak sınırlı kabul edilir. Bu kapsam, herhangi bir organizmanın patojenleri ve yerleşik mikropları arasındaki mikrobiyal etkileşimleri incelemek istediğinde belirgindir. Bu etkileşimlerin epidemiyolojik olarak çok önemli olduğu bilinmektedir ve hastalığı etkileyebilir. Bu nedenle, birden fazla patojeni aynı anda tespit edebilen ve bunların mevcut mikroorganizmalar bağlamında yerleştirilmesine olanak tanıyan yeni metodolojiler geliştirmek çok önemlidir. Bunu akılda tutarak, klinik teşhis, herhangi bir patojenin varlığının yanı sıra diğer mikroorganizmalar, mikrobiyal topluluklar ve topluluklarla etkileşimlerini incelemek için yeni yaklaşımlar gerektirir.
Özellikle virüsler, Dünya’da en bol bulunan yaşam biçimleridir. Bununla birlikte, laboratuvar koşullarında birkaç grup yetiştirilebilir. Diğerleri arasında elektron mikroskobu, hücre kültürü, aşılama ve seroloji gibi çeşitli yöntemler kullanılarak tanımlanabilirler. Tüm bu teknikler, bilinen virüslerle karşılaştırmalara dayandığından, virüs hakkında önceden bilgi sahibi olmayı gerektirir. Laboratuvarda yetiştirilemeyen virüsler, mikrodizi, çıkarıcı hibridizasyon tabanlı yöntemler ve PCR tabanlı yöntemler gibi moleküler yöntemlerle tanımlanabilir. Virüsleri karakterize etmek için moleküler yöntemlerin uygulanması, hedef virüs hakkında önceden bilgi sahibi olmayı da gerektirir. Ancak, bazı yeni yaklaşımlar bu sınırlamayı aştı. Diziden bağımsız tek primer amplifikasyonu, oligonükleotitle hazırlanmış PCR, rastgele PCR ve dönen daire amplifikasyonudur. Bununla birlikte, tüm bu teknikler, hem hayvanlarda hem de insanlarda viromun tam olarak anlaşılmasına izin vermez.
Yeni nesil dizileme (NGS) teknolojileri, insanlarda ve hayvanlarda viral yapıyı tam olarak anlamak için kesinlikle yeni araçlardır. Bu dizileme araçları, insanlarda ve hayvanlarda araştırma ve teşhiste birçok uygulamaya sahiptir. Hayvanlarda patojenik virüsleri tanımlamak için yüksek verimli araştırmalara izin verirler. Yeni nesil sıralama teknolojileri, birkaç kopyadaki herhangi bir virüsü tespit edebilen binlerce ila milyonlarca okuma sağlar. Bu nedenle, zoonotik hastalıkların anlaşılmasını ilerletmek ve herhangi bir organizmanın viral kompozisyonunu araştırmak için daha küresel çalışmalara ihtiyaç vardır.
kaynak:
ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7019290/
Clinicalmicrobiologyandinfection.com/article/S1198-743X(16)00017-3/pdf
yazar: Özlem Güvenç Ağaoğlu
Diğer gönderilerimize göz at
[wpcin-random-posts]