İnsan patojenlerinin yaklaşık %60’ı zoonotik kökenli olduğundan, zoonotik hastalıklar küresel bir halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır. Zoonozların teşhisi için, çok çeşitli patojenlerin tanımlanmasına izin veren kültür bazlı ve immünohistokimyasal yöntemler dahil olmak üzere çeşitli metodolojiler geliştirilmiştir. Ancak bazıları bu yöntemlerle kolaylıkla tespit edilememektedir. Ek olarak, patojeni veya karışımlarını tanımlamak için moleküler testler geliştirilmiş ve tasarlanmıştır. Bu bağlamda metagenomik, bir mikrobiyal topluluğu oluşturan farklı mikroorganizmaların genom dizilerinin elde edilmesine bir alternatif olarak karşımıza çıkmaktadır. Metagenomik, laboratuvar koşullarında büyütülemeyen mikropları ve viromları karakterize etmek için kullanılmıştır.
İçindekiler
Zoonotik hastalıkların tersine bulaşması
Bazı patojenler insandan insana geçebilse de, zoonoz hayvanlardan insanlara bulaşma ile ilişkilendirilmiştir. Hayvan botulizmi, çift yönlü zoonoz, antroponoz, antroponoz, insandan hayvana bulaşma ve ters zoonoz, herhangi bir insan patojeni hayvanlara bulaştığında gösterilir. Parazitlerin insandan hayvana ilk bulaşması 2000 yılında yayınlandı. Genel olarak antropozon hastalığı ve ekolojisi yeterince incelenmemiştir; Ancak dünyada önemli bir sağlık sorunu olarak tanımlanmaktadır. tuberculosis mikrop, M. bovis, Staphylococcus aureus, metisiline dirençli bakteri, Streptococcus pneumoniae, Campylobacter sp, Salmonella sp, Shigella sonny, s. Boyde, s. Flexneri, Escherichia coli, oksasiline dirençli bakteriler, Helicobacter pylori çiftlik hayvanları, yaban hayatı ve evcil hayvanlarda geri dönüşümlü zoonotik hastalıklara neden olan bakterilerden bazılarıdır.
Hepatit E, kızamık, insan pnömovirüsleri, influenza A (H1N1), rotavirüs, insan herpesvirüsleri 1 ve 4 ve insan adenovirüs AF gibi virüslerin de insanlardan hayvanlara bulaşan zararlı zoonotik ajanlar olduğu rapor edilmiştir. Bakteriler (%38) ters zoonozların yaygın ajanlarıdır ve diğer virüsler (%29), parazitler (%21) ve mantarlar (%13) da insandan hayvana bulaşmada rol oynar. Bu tür kirlilik, Antarktika hariç tüm kıtalarda incelenmiş ve gerçekleştirilmiştir. Kuzey Amerika prevalansın en yüksek olduğu bölgedir. Ana bulaşma yolları fomit, oral temas, aerosoller ve aşılamayı içerir.
Vahşi yaşamdan insanlara bulaşmayı açıklamak için iki bulaşma modu tanımlanmıştır. İlk durumda, vahşi yaşamdan kaynaklanan viral bir hastalık nadiren insanlara bulaşır ve daha sonra yatay olarak insandan insana bulaşabilir. Bu modelde virüs insanlarda döngüsünü devam ettiriyor. Semptomatik immün yetmezlik virüsü bu modelin başlıca örneğidir. İkinci model, herhangi bir mafsallı araç gibi iki veya daha fazla hayvan ve insanı içerir. Bu durumda, insandan insana bulaşma çok nadirdir, örneğin Batı Nil virüsü. Ters zoonoz ürettiği bulunanlar da dahil olmak üzere patojenik bakteriler, parazitler, virüsler ve mantarlar, hasta hayvanların ve insanların metagenomik profilinin analizi yoluyla tanımlanabilir. Metagenomik ayrıca patojenik popülasyonların dinamikleri ve ekolojisi hakkında yeni ve faydalı bilgiler sağlayabilir. Diğer global transkriptom çalışmaları, farklı konakçılarda farklı patojen transkript seviyeleri önerebilir. Bu araştırma, farklı ev sahipleri için özel tedaviler tasarlamak için önemli bilgiler sağlar.
Virüsler yaklaşık 200 tür insan patojeni içerir ve yılda iki kez yeni patojen virüsleri keşfedilir. Kuş ve domuz gribi salgınları gibi bazı virüsler türler arasında hızla sıçrayabildiği için viral tropizm geniş çapta tartışılmaktadır. Bu noktalar, retroviral zoonotik hastalıkların incelenmesi ve antroposonozda yer alan yeni viral mutasyonların ve özelliklerin tanımlanması için çekicidir. Bazı yazarlar 36 ile 562 arasında viral patojenin tespit edilmeyi beklediğini bildirmiştir. Bazıları hayvan hastalığına neden olma potansiyeline sahiptir.
Metagenomik ve izleme yazılımı
Bu bölümde bahsedildiği gibi metagenomik, çeşitli vahşi ve evcil hayvan ve insanların virüsleri ve mikrobiyomlarının incelenmesi için güçlü bir yaklaşım sağlar. Bu tür konaklarda yeni ve yeniden ortaya çıkan enfeksiyöz ajanların keşfi, yalnızca bulaşıcı hastalıkların ekolojisi ve epidemiyolojisi ile ilgili bir halk sağlığı bilgisi kaynağı değildir. Ayrıca uygun izleme programlarının oluşturulmasına da olanak tanır. Bulaşıcı hastalıkların insandan insana bulaşmasını önlemek, özellikle gelişmekte olan ülkelerde küresel bir tehdit olmaya devam etmektedir. Nüfus artışı, zoonozları kolaylaştırma konusunda önemli bir risk sunmaktadır. Ek olarak, insan yerleşimlerinin daha önce yerleşim olan alanlara dağılımı, bulaşıcı hastalıkların bulaşmasını kolaylaştırarak enfeksiyon oranını, coğrafi dağılımı ve bulaşıcı ajanların dahil edilmesini etkiler.
Haagmans ve ekibi, soğuk solunum sendromu koronavirüsünün (MERS-CoV) insanlara bulaşmasında develerin rolünü gösterdi. Bu tarihler, zoonotik faktörlerin deposu sayılmayan hayvan türlerinde metagenomik çalışmaların önemini göstermektedir. Ek olarak, eklembacaklılar, vahşi ve evcil hayvanlar gibi yeni konakçıları içerebilen bulaşıcı hastalıklarda sürveyans programlarını geliştirebilir.
Epidemiyolojik sürveyans programlarına, özellikle bu hastalıkların görülme sıklığının arttığı gelişmekte olan ülkelerde, zamanında ve uygun müdahaleye izin veren ekonomik kapasite, altyapı, araştırma ve multidisipliner eşlik etmelidir. Pan Amerikan Sağlık Örgütü tarafından Latin Amerika’nın farklı ülkelerinde sağlık bakanlıklarının katılımını içeren bir çalışma yapılmıştır. Bu araştırma aynı zamanda ülkelerde ortaya çıkan bulaşıcı hastalıklara yönelik en büyük ihtiyacın bu tür hastalıklara yönelik teşhis ve laboratuvar yeteneklerinde yattığını da göstermiştir. Kuduz, leptospiroz, bruselloz, Batı Nil virüsü, sığır süngerimsi ensefalopati, Ebola virüsü hastalığı ve kuş gribi sürveyans koşullarıdır. Bu bağlamda metagenomik, insan sağlığını tehdit edebilecek yeni türlerin keşfedilmesi için potansiyel bir araçtır. Ayrıca ortaya çıkan hastalıkları izlemek için kullanılır.
Analiz edildiğinde metagenomik, hayvanlarda ve insanlarda virüslerin ve mikrobiyomların incelenmesi için güçlü ve yararlı bir yaklaşım sağlar. Metagenomik çalışmalardan elde edilen ilgili bilgiler, zoonotik hastalıklara ve bunların insanlarla ilişkilerine yeni bir vurgu sağlar. Bu nedenle, metagenomik, yeni virüslerin ve diğer hayvan ajanlarının, hatta insan patojenlerinin varlığını tespit etmek için teşhis faaliyetlerinde kapsamlı olmalıdır. Metagenomik ayrıca mikrobiyal popülasyonların ve toplulukların yapısal bileşimi ve çeşitli hayvan hastalıkları sırasında bunları nasıl değiştirebilecekleri hakkında bilgi sağlar. Bu nedenle, kültürden bağımsız yöntemler, karmaşık örneklerle çalışmaya ve ilişkili mikrop ve virüsleri ayrıntılı olarak tanımlamaya izin verdiği için hayvan biyodiagnostiğinde yeni fırsatlar açar.
kaynak:
ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3938448/
healtheuropa.eu/reverse-zoonosis-human-pathogens/89348/
yazar: Özlem Güvenç Ağaoğlu
Diğer gönderilerimize göz at
[wpcin-random-posts]