Bir peptit, kısa bir amino asit zinciridir. Bir peptiddeki amino asitler, peptit bağları adı verilen bağlarla bir dizide birbirine bağlanır. Peptitler genellikle proteinlerden daha kısa uzunluklarıyla ayırt edilirler, ancak peptidi ve proteini tanımlamak için kesilen amino asitlerin sayısı isteğe bağlı olabilir. Peptitler genellikle iki veya daha fazla amino asidin kısa zincirleridir. Bu arada proteinler, polipeptit alt birimlerinden oluşan ve polipeptitler olarak da bilinen uzun moleküllerdir. Proteinler, enzimler (diğer proteinler) tarafından kısa peptit parçalarına sindirilebilir. Hücreler arasında peptitler biyolojik işlevleri yerine getirebilir. Örneğin, bazı peptitler, hücrelerden salındıklarında vücudun diğer bölgelerini etkileyen moleküller olan hormonlar gibi davranırlar.
Tuzak peptitleri veya tuzak reseptörleri, belirli bir reseptör proteininin rolünü taklit etmek için özel olarak tasarlanmış moleküllerdir. Hedef varlıkları onlarla etkileşime girmeye teşvik eder, böylece bu etkileşimler incelenebilir ve analiz edilebilir, hatta belirli bir aktiviteyi veya yanıtı başlatmak için kullanılabilir. Hedef hücrelere alınmalarını kolaylaştırmak için genellikle hücreye nüfuz eden bir peptit veya monoklonal antikora bağlanırlar. Çeşitli amaçlar için kullanılabilirler ve herhangi bir duruma uyacak şekilde tasarlanırlar. Son yıllarda, tuzak peptitlerin çeşitli hastalıkları tedavi etmek için nasıl yeni terapötik yaklaşımlar sunabileceğini açıklayan çok sayıda araştırma yayınlandı. Farklı biyolojik sistemlerin anlaşılmasını keşfetmek ve derinleştirmek için de kullanılır.
İçindekiler
kanser
Son araştırmalar, bloke edici peptitlerin potansiyel yeni kanser tedavilerinin geliştirilmesine yardımcı olmada başarılı bir şekilde kullanıldığını göstermiştir. Drug Discovery Today’de yayınlanan bir araştırma makalesi, peptit tuzağı teknolojisinin nasıl geliştiğini ve meme kanseri için yeni bir terapötik yaklaşım olarak nasıl yerleştiğini anlatıyor. Birçok meme kanseri türü vardır. Bazıları mevcut tedavilere dirençlidir veya tedavi edilemez olarak kabul edilir. Meme kanseri kadınlarda en sık görülen kanser türü olduğundan, araştırmacılar tedavi sonuçlarını iyileştirebilecek daha etkili tedavi yaklaşımları geliştirmek için çalışıyorlar.
Drug Discovery Today’de yayınlanan çalışma, distal peptitlerin, meme kanseri patogenezinde yer alan spesifik ligandlarla (enflamatuar sitokinler) yüksek etkileşim yoluyla onkojenik sinyal yollarını inhibe edebildiğini gösterdi. Ek olarak, önceki çalışmalar, yem peptitlerinin diğer kanser türlerini hedeflemede etkili olduğunu göstermiştir ve bazı çalışmalar bunların gelecekte aşı ve kanser immünoterapisi geliştirmek için kullanılabileceğini düşündürmektedir.
hemofili bir
Son zamanlarda yapılan bazı çalışmalar, hemofili A’yı patojenik nötralize edici antikorlar ve tuzak peptitleri ile tedavi etmek için yeni yaklaşımlar önermektedir. Hemofili ölümcül olabilen genetik bir hastalıktır ve semptomları faktör VIII (FVIII) eksikliğinden kaynaklanır. Hemofili hastalarının, kan pıhtılaşma faktörünün (FVIII) aktivitesini inhibe eden faktöre (FVIII) karşı antikorlar geliştirdiği gözlenmiştir. Araştırmalar, yem peptitlerinin FVIII inhibitörlerinin aktivitesini nötralize etmek için kullanılabileceğini, faktör VIII’in aktivasyonunun artmasına izin vererek hastalığın semptomlarını azalttığını göstermiştir. Araştırma henüz başlangıç aşamasındayken, patolojik antikorları nötralize etmek için yeni terapötik yaklaşımlar oluşturmak üzere peptit tuzaklarının geliştirilebileceğine inanılıyor.
Ağrı ayarı
Ek olarak, araştırmalar yem peptitlerinin ağrı modülasyonu bilgisini derinleştirmek ve hatta ağrıyı azaltmak için yeni ilaç hedeflerine kapı açmak için kullanılabileceğini göstermiştir. Artan kanıtlar, Toll benzeri reseptör (TLR) olarak bilinen bir sinyal dönüştürücü protein ile Toll/Interleukin-1 reseptörü (TIR) arasındaki duyusal nöronlar tarafından ağrının modülasyonunda bir rol olduğunu düşündürmektedir. Ligandın TLR’ler ile etkileşiminden sonra, sinyal dönüştürücü proteinlerin TIR aktivasyonunun başlatılmasıyla hücre içi sinyalleşmenin aktivasyonu gözlenir. TLR ve TIR’ın, TLR sinyal kaskadı için hayati olduğu uzun süredir bilinmesine rağmen, bu reseptörlerin ağrı modülasyonundaki tam işlevi belirsizliğini koruyor.
Tuzak peptitlerini kullanan son araştırmalar bu bilgi eksikliğini gidermiştir. Bilim adamları, bu bölgelerin LPS ile indüklenen hücre içi kalsiyum akışını, duyusal nöronlarda uyarımı ve dokunsal ağrının (ağrı hassasiyeti) uyarılmasını etkilediğini keşfetmek için TLR TIR’ı yakalamak üzere modifiye edilmiş peptidler kullandılar. Bilim adamları, psödopeptitleri kullanarak, TLR TIR alanlarının ağrı kesici için yeni ilaç hedefleri olarak hizmet edebileceğini belirleyebildiler.
proteomik
Proteomik ve proteinlerin ve fonksiyonlarının incelenmesi, peptit tuzaklarının kullanımından büyük fayda sağlamıştır. Tandem kütle spektrometresi kullanan büyük ölçekli proteomik analizler, proteinlerin ve peptitlerin yanlış tanımlanmasını tahmin etmek için büyük ölçüde doğru araçlara dayanır. Peptid tuzaklarının kullanımı, bu temel tahminleri oluşturmak için etkili bir yaklaşım olarak ortaya çıkmıştır. Yöntem nispeten basittir: hatalı kodlamalar kasıtlı olarak dizilere eklenir ve arama alanında doğru kabul edilen yanlış arama sonuçlarına karşılık gelir. Bu yöntem, proteomik alanında iyi bir şekilde yerleşmiştir ve araştırmacıların yanlış sonuçları doğru bir şekilde tahmin etmelerine ve filtre kriterleri tasarlamak için tuzaklar kullanmalarına olanak sağlamıştır.
Bu, peptit tuzağı uygulamalarının kapsamlı bir listesi olmasa da, bu moleküllerin sunabileceği çok çeşitli terapötik fırsatları göstermektedir. Peptit tuzağı teknolojisinin, bugüne kadar büyük başarılar elde ettiği bir endüstri olan özellikle ilaç geliştirmenin ilk aşamalarında, biyolojik ve tıbbi araştırmalarda kullanılmaya devam etmesi bekleniyor.
Peptid ve protein arasındaki fark nedir?
Proteinler ve peptitler, önemli biyolojik işlevleri yerine getiren hücrelerin temel bileşenleridir. Örneğin, proteinler, hücre dışı ortamdan verilen şekil ve sinyallerle hücrelere yanıt verir. Bazı peptit türleri, diğer moleküllerin aktivitelerini düzenlemede önemli bir rol oynar. Yapısal olarak, proteinler ve peptitler birbirine çok benzerler ve peptit bağlarıyla (amid bağları olarak da adlandırılır) birbirine bağlanan amino asit zincirlerinden oluşurlar.
Ana ayırt edici faktörler boyut ve yapıdır ve peptidler proteinlerden daha küçüktür. Geleneksel olarak peptitler, 2 ila 50 amino asitten oluşan moleküller olarak tanımlanırken, proteinler 50 veya daha fazla amino asitten oluşur. Ek olarak peptitler, ikincil, üçüncül ve dördüncül yapılar olarak bilinen karmaşık yapıları benimseyebilen daha az yapılandırılmış proteinler olarak tanımlanma eğilimindedir. Peptitler ve proteinler arasında fonksiyonel bir ayrım da yapılabilir.
Bununla birlikte peptitler, birkaç amino asitli (örn. 2 ila 20) oligopeptitlere ve birçok amino asitli polipeptitlere bölünebilir. Proteinler bir veya daha fazla birleştirilmiş polipeptitten oluşur, bu nedenle proteinler esasen çok büyük peptitlerdir. Aslında, bazı araştırmacılar peptit terimini özellikle oligopeptitleri veya nispeten kısa amino asit zincirlerini ifade etmek için kullanırlar. Bununla birlikte, polipeptit terimi, 50 veya daha fazla amino asitten oluşan proteinleri veya zincirleri tanımlamak için kullanılır.
kaynak:
https://www.nature.com/articles/s41598-017-03447-9#citeas
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1359644620300362
ashpublications.org/…/Peptide-decoys-selected-by-phage-display-block-in
journalals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0050651
yazar: Özlem Güvenç Ağaoğlu
Diğer gönderilerimize göz at
[wpcin-random-posts]