NHS’de tüm genom dizilimini kullanan öncü bir araştırma programı, yüzlerce hastayı teşhis etti ve hastalığın yeni genetik nedenlerini keşfetti. Tüm genom dizileme, hükümetin NHS’de rutin genetik teşhis testleri sunmayı amaçlayan bir hizmet olan 100.000 Genom Projesi tarafından kullanılan bir teknolojidir. National Institute for Health Research BioResource ve Genomics England’daki araştırmacılar tarafından ortaklaşa yürütülen bu çalışma, çok sayıda bireyden alınan standart tam genom diziliminin nadir hastaların teşhis ve tedavisini iyileştirebileceğini gösteriyor.
Araştırmacılar, beyin, gözler, kan veya bağışıklık sistemi gibi farklı dokuları etkileyen benzer semptomlara sahip hasta gruplarının genomlarını inceledi. Erken görme kaybı olan bir hasta grubundaki bireylerin %60’ına genetik tanı koydular. Sonuçları Nature’da iki makalede yayınlanan program, klinik genomik için dünyada bir ilk olan entegre bir sağlık sisteminde nadir hastalıkları olan hastalar için bir teşhis testi olarak tüm genom dizilemesini tanıttı. Genetik araştırmanın NHS teşhis sistemleriyle entegrasyonu, bir hastaya teşhis konma olasılığını artırır ve teşhisin aylar yerine haftalar içinde konma olasılığını artırır.
Her yıl yaklaşık 40.000 bebek, yalnızca Birleşik Krallık’ta nadir görülen bir genetik hastalıkla doğuyor. Ne yazık ki, teşhis koymak ortalama iki yıldan fazla sürüyor. Hastalar ve ebeveynler için bu yolculuğun kısa olması hayati önem taşımaktadır. Bu araştırma, daha fazla NHS hastası için daha hızlı ve daha iyi genetik teşhisin mümkün olacağını gösteriyor. Öncelikle Ulusal Sağlık Araştırmaları Enstitüsü tarafından finanse edilen çalışma, nadir hastalıkları olan yaklaşık 10.000 NHS hastasının tüm genomlarını sıraladı ve durumlarının genetik nedenlerini inceledi. Daha önce, bilinen nadir hastalıklara neden olan gözlemlenmemiş genetik varyasyonların yanı sıra tamamen yeni genetik hastalıklara neden olan genetik varyasyonlar tanımlanmıştı. Ekip, hastaların genomlarında çoğu önceden bilinmeyen 172 milyondan fazla genetik farklılık tespit etti. Bu genetik varyasyonların çoğunun insan sağlığı üzerinde hiçbir etkisi yoktu, bu nedenle araştırmacılar, samanlıkta iğne aramak kadar zor olan hastalığa neden olan varyasyonları bulmak için yeni istatistiksel yöntemler ve güçlü süper bilgisayarlar kullanıyorlar.
Nature’da bağımsız bir makale olarak yayınlanan programla ilgili bir çalışmada, araştırmacılar, bağışıklık sisteminin mikroplarla enfeksiyonla savaşma yeteneğini etkileyen bir durum olan birincil immün yetmezliği olan 886 hastayı incelediler ve dört yeni ilişkili gen belirlediler. Londra’daki UCL Great Ormond Street Çocuk Sağlığı Enstitüsü’nden (ICH) Profesör Adrian Thrasher, kalıtsal bağışıklık bozukluğu olan hastalara en iyi tedaviyi ve en uygun bakımı sağlamanın kesinlikle doğru moleküler teşhise bağlı olduğunu söyledi.
Çalışmaları, bu bağlamda tüm genom dizilemenin değerini gösteriyor ve bazıları halihazırda hasta bakımını iyileştirmiş olan bir dizi yeni teşhis aracı sunuyor. Proje için özel olarak geliştirilen yeni bir analiz yöntemini kullanan ekip, nadir genetik varyasyonların nadir hastalıkların istatistiksel bir nedeni olduğu 95 gen belirledi. Bu genlerin 79’undaki genetik varyasyonların hastalığa neden olduğu kesin olarak kanıtlanmıştır.
Her hastanın genomunu oluşturan 3,2 milyar DNA harfinin neredeyse tamamı, nadir görülen genetik varyasyonlar için arandı. Bu, genellikle genetik varyasyonların hastalığa neden olduğu düşünülen harflerin küçük bir kısmını tarayan mevcut klinik genetik testlerle çelişir. Tüm genomu inceleyen araştırmacılar, genomda binlerce genin aktivitesini kontrol eden DNA’daki düzenleyici öğeler olan anahtarları ve karartıcıları keşfetmeyi başardılar. Ekip, genin kendisini devre dışı bırakmak yerine, bu anahtarlar ve karartıcılardaki nadir varyasyonların, genin doğru yoğunlukta çalışıp çalışmadığını etkilediğini gösterdi. Nadir hastalıklara neden olan düzenleyici unsurlardaki genetik değişiklikler, şu anda dünya çapında sağlık hizmetleri tarafından kullanılan klinik genetik testlerle tanımlanamamaktadır. Ancak her hastanın genetik kodunun tamamı analiz edildiğinde mümkündür. Sağlık sistemi içinde nadir hastalıkları olan hastaların rutin tam genom dizilimi, hastalara önceki yaklaşımlara göre daha hızlı ve daha doğru teşhis hizmeti sağlarken, hastalar için gelecekteki faydalar için genetik araştırmayı geliştirmeye devam ediyor.
Birleşik Krallık’ta ve yurt dışında yüzlerce klinisyen ve araştırmacının katkıları sayesinde, çok nadir görülen hastalıkların nedenlerini belirlemeye yetecek kadar hastayı inceleme olanağına sahip oldular. Bireysel nadir hastalıklar nüfusun çok küçük bir bölümünü etkilemesine rağmen, binlerce nadir hastalık mevcuttur ve Birleşik Krallık’ta üç milyondan fazla insanı etkiler. Bu zorluğun üstesinden gelmek için NIHR BioResource, nadir hastalıkları olan hastaların bakımına odaklanan 57 NHS hastanesinden oluşan bir ağ oluşturmuştur. Bu hastanelerde çalışan yaklaşık 1.000 doktor ve hemşire hastalarından ve bazı durumlarda etkilenen çocukların ebeveynlerinden NIHR BioResource’a katılmalarını isteyerek projeyi mümkün kıldı.
Sağlık Bakanlığı Bilim, Araştırma ve Kanıt Direktörü Dr Louise Wood, NIHR BioResource projesini oluştururken, NHS ve ötesindeki hastalar için tanı ve tedaviyi iyileştirmek için kararlı bir çaba sarf etti. Sosyal Bakım ve Baş Tıbbi Görevlisi Profesör Chris Whitty ile birlikte Ulusal Sağlık Araştırmaları Enstitüsü’nün tüm sorumluluğuna sahiptir. Bu bilimsel raporda yer alan NIHR tarafından finanse edilen araştırmacılar, bilimi ilerletmeye ve NHS genelinde klinik uygulamaya dönüştürmeye çalıştıkları için ilk tartışmaların bir parçasıydı. Bu araştırmada, hastalar, aileleri ve sağlık hizmetleri, uygun ortamlarda genetik dizilimi klinik bakımın ön saflarına koymaktan yararlanır. NHS’nin Genomics UK ve Birleşik Krallık’taki akademik araştırmacılarla ortaklaşa yaptığı çığır açan araştırmalar, bazı hastaların neden böyle bir deneyim yaşayabileceğine dair ipuçları bulma umuduyla bu yeni hastalık için aynı genom testini COVID-19 hastalarına uygulamak için zemin hazırladı. ağır durum dış görünüş.
Mevcut NIHR BioResource çalışmasından ve Genomics England tarafından yapılan diğer çalışmalardan ortaya çıkan verilere dayanarak, Birleşik Krallık hükümeti Ekim 2018’de NHS’nin, kanser olanlar da dahil olmak üzere genetik hastalık şüphesi olan tüm kritik derecede hasta çocuklara tam genom dizileme analizi sunacağını duyurdu. Tüm genom dizilemesini 2024 yılına kadar yılda 1 milyon genoma çıkarmayı planlıyorlar. Tüm genom dizilemenin, ulusal düzeyde nadir hastalıkların teşhisi için bakım standardı olarak aşamalı olarak kaldırılacağı ve eşdeğer bakımın ülke çapında sağlanacağı bildirildi. Yararları arasında hastalar için daha hızlı teşhis, daha düşük sağlık bakım maliyetleri, hastalar ve bakıcıları için hastalık nedenlerinin daha iyi anlaşılması ve iyileştirilmiş tedavi yer alır.
kaynak:
doi.org/10.1038/s41586-020-2434-2.
https://www.news-medical.net/news/20200624/Whole-genome-sequencing-can-improve-diagnosis-and-treatment-of-patients-with-rare-diseases.aspx
https://www.nature.com/articles/s41598-019-55832-1
yazar: Özlem Güvenç Ağaoğlu
Diğer gönderilerimize göz at
[wpcin-random-posts]
İlk Yorumu Siz Yapın